Fakultas Ekonomi Universitas Djuanda (FEKON-UNIDA) adalah salah satu penyelenggara kegiatan akademik di UNIDA, khususnya dalam bidang ilmu ekonomi.   FEKON UNIDA berdiri tahun 1987 dengan Program S1 Jurusan  Manajemen. Satu tahun kemudian dibuka Program S1 Jurusan Akuntansi. Perkuliahan diadakan antara tiga sampai empat shift per hari mulai pukul 7.30 s/d 16.30, kecuali hari Sabtu (7.30 s/d 13.00). Untuk memberi kesempatan kepada pengusaha muda atau karyawan yang berkemauan menambah pengetahuannya, sejak tahun akademik 1997/ 1998 dibuka perkuliahan kelas sore untuk jurusan Manajemen dengan waktu kuliah pukul 18.15 s/d 21.00 WIB, kecuali hari Sabtu mulai pukul 14.00  s/d 16.00 WIB.

Wisuda perdana program S1 Jurusan Manajemen dilaksanakan pada September 1992 dan satu tahun kemudian menyusul program S1 Jurusan Akuntansi melepas wisudawannya untuk mengabdi pada masyarakat.. Para wisudawan umumnya menjadi karyawan pada berbagai bidang usaha dan  instansi pemerintah, dan cukup banyak diantaranya yang berusaha mandiri (sebagai wirausahawan).

Pada saat ini Fakultas Ekonomi mempunyai  dua Program Studi masing-masing adalah:

1. Program Studi Manajemen, Program S1, status Terakreditasi BAN-PT, berdasarkan Surat Keputusan DIKTI Nomor 012/ BAN-PT/ Ak-VII/ S1/ VII/ 2003 dengan peringkat B.

2. Program Studi Akuntansi, Program S1, status Terakreditasi BAN-PT, berdasarkan Surat Keputusan DIKTI Nomor 019/ BAN-PT/ Ak-VII/ S1/ VIII/ 2003 dengan peringkat B.

Program Studi Manajemen dan Akuntansi dikoordinasikan oleh Ketua Program Studi dan Sekretaris Program Studi.