Universitas Djuanda Bogor yang didirikan oleh almarhum Bapak H. Alamsjah Ratu Perwiranegara (Mantan Menteri Agama RI) di bawah naungan Yayasan Pusat Studi dan Pengembangan Islam (YPSPI) bertujuan menjadi media dalam upaya meningkatkan kualitas sumber daya manusia Muslim dalam rangka memberi nilai tambah bagi kemajuan dan pengabdiannya pada umat manusia, bangsa dan negara.

Fakultas Studi Islam Universitas Djuanda Bogor, membuka kesempatan kepada generasi muda Muslim untuk melanjutkan studi ke jenjang Sarjana (S1) pada program studi : (1) Kependidikan Islam (PEI), dan (2) Muamalat/Ekonomi Islam (MEI) dengan masa perkuliahan dapat ditempuh 3,5 tahun.

Dalam proses pendidikan, selain mengikuti kegiatan akademik para mahasiswa juga dibina untuk menemukan jati diri dengan mengikutsertakan mereka dalam kegiatan intra dan ekstrakurikuler. Disamping itu mahasiswa mendapat bimbingan bahasa Arab dan Inggris secara terstruktur oleh dosen yang berkompeten.

A.  Program Studi Kependidikan Islam (Terakreditasi)
Program Studi Kependidikan Islam bertujuan menghasilkan lulusan yang memiliki wawasan keilmuan dan kemampuan di bidang menajemen pendidikan dan profesi keguruan. Program Studi ini memiliki konsentrasi Manajemen Pendidikan Islam (MPI) dan Pendidikan Agama Islam (PAI). 

B.  Program Studi Muamalat/Ekonomi Islam bertujuan menghasilkan lulusan yang memiliki wawasan keilmuan di bidang Ekonomi Islam dan kemampuan mendirikan, mengelola dan mengembangkan Lembaga Ekonomi Islam sebagai basis ekonomi untuk mendirikan kemandirian umat. Program Studi ini memiliki konsentrasi Perbankan Syariah.